pear -V
の出力結果を教えていただけますか？
ちなみにさくらの場合、PHPの置き場所をころころと変えてしまうので、、、この例でいうと
$HOME/local/bin/pear
の中身を書き換える必要があるかもしれません。
その辺の話を下記にも書いたので参考にしてみてください。
http://ueblog.natural-wave.com/2009/08/08/dont-run-pear-on-sakurainternet/
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bonnaroo より
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